東京湾に浮かぶ孤島に幽閉されていた闇のダークヒーロー「シャドウ」が、長い眠りから目を覚まし東京・渋谷に降臨した。この緊急事態に、ソニック、テイルス、ナックルズが派遣され、スクランブル交差点のど真ん中でシャドウと対峙する。